Безконтрольне застосування ІПП може спричинити підвищений ризик розвитку пневмонії та інфекції Clostridium difficile в умовах стаціонару. FDA винесло застереження щодо можливого ризику розвитку остеопорозу та переломів, гіпомагніємії на фоні прийому ІПП.