Омепразол можна приймати постійно чи довгими курсами. Препарат приймають 1 раз на добу, оскільки терапевтичний ефект від одноразового прийому триває 24 години. Якщо приймати омепразол рідше ніж 1 раз на добу, терапевтичний ефект буде недостатнім та непередбачуваним.