Як і будь-якою іншою рослиною, ліками чи їжею, естрагоном не слід зловживати. У зв'язку з тим, що до складу тархуна входять деякі небезпечні речовини, безконтрольне вживання цієї трави у великих кількостях загрожує нудотою, блюванням, втратою свідомості та судомами.