Для амінокислот характерна структурна ізомерія, яка обумовлена різною будовою вуглецевого ланцюга та взаємним розташуванням аміно- та карбоксильної груп.

Оптична ізомерія (Енантіомерія) Серед органічних сполук зустрічаються речовини, здатні обертати площину поляризації світла. Це явище називають оптичної активністю, а відповідні речовини – оптично активними.

Для амінокислот відомі два види ізомерії: структурна та просторова (оптична ізомерія). Структурна ізомерія пов'язана з особливостями будови вуглецевого скелета та взаємним розташуванням функціональних груп.

Обумовлена різним порядком з'єднання атомів у складі молекули.