Забруднення та осушення водойм, збирання квіток і плодів та виловлювання з дна кореневищ у декоративних та харчових цілях. По берегах лотос охоче поїдають дикі кабани та худобу. Замулювання озер та зміна режиму річок, будівництво гребель, іноді випасання худоби. Велику шкоду завдають чагарникам кабани.
Відповідно до ст. 8.35 КоАП РФ (знищення рідкісних рослин, що знаходяться під загрозою зникнення), що зірвав лотос ризикує отримати штраф від 1500 до 2500 рублів.
У період цвітіння у нас організовано рейди. Нюанс у тому, що багато людей, які навіть не рвуть лотоси, Витоптують прибережну зону, а цього робити теж не можна, – коренева система лотосів дуже чутлива, і при ущільненні мулу взимку може відбуватися вимерзання коріння, яке саме в цьому мулі і зимує.
У різних традиціях з Лотосом пов'язуються також життя, чистота, андрогінність, злагода, мрійливість, забуття, мир, тиша, твердість, безперервність, сонце. Структура квітки Лотоса (периферійна, пелюсткова частина та центр) символізує взаємодію жіночого та чоловічого начал.