Причини пов'язані з генетичною схильністю, сімейним наслідуванням від батьків, патологічним перебігом вагітності. Причиною може стати черепно-мозкова травма, ДЦП, інші патології нервової системи. Диспраксія входить до симптоматики синдрому Дауна, аутизму, синдрому Вільямса.