Причини виникнення хворобливого сприйняття звуків – патологія слухової системи, що виникла внаслідок різних захворювань, наприклад, менінгіту, травм мозку, пухлин тощо; захворювання вух, у тому числі хвороба Меньєра; запалення трійчастого лицевого нерва.
Мізофонію іноді називають селективною звуковою чутливістю. Це стан, за якого людина вкрай емоційно негативно реагує на деякі звуки. Є три типи реакції: лють, огида і тривога, причому основною є лють.
Людина з підвищеною сприйнятливістю може чути звуки так само, як і всі інші, але сприймати їх як більше гучні, настирливі або дратівливі. Можливі причини можуть бути різними – від мігрені чи неприємних спогадів до психічних розладів.