Його основна причина – випадкова генетична мутація, внаслідок якої у 21 парі хромосом з'являється третя зайва хромосома. Частота явища – приблизно 1 випадок на 600-800 дітей.
Практично завжди зайва хромосома передається дитині з синдромом Дауна від матері. Зі збільшенням віку матері підвищується ризик народження дитини із синдромом Дауна.
Достеменно відомо і доведено, що ймовірність народження дитини з синдромом Дауна Дещо підвищується у матерів старше 35 років, особливо якщо це перша вагітність. Проте майже 80 % дітей з синдромом Дауна народжені у мам молодше цього віку, оскільки молоді жінки народжують частіше.
Синдром Дауна – це вроджена хромосомна аномалія, що полягає в наявності зайвої хромосоми в 21 парі (трисомія по 21 парі хромосом). У людини 23 пари хромосом, таким чином, звичайна дитина має 46 хромосом, а дитина з синдромом Дауна – 47.