Через нього порушується баланс екосистеми: рибам і тваринам може не вистачати сонячного світла та кисню. Крім того, при цвітінні деякі види водоростей виробляють токсини, які небезпечні для людей і тварин.
Працівники Мособлпожспасу не рекомендують купатися у такій водіЦе може бути небезпечним для здоров'я. Під час цвітіння в воді стає багато мікробів і нітратів, отже, є ризик отримати серйозне отруєння. Також така вода може спричинити сильну алергічну реакцію.
— Купатися у квітучих водоймах не можна? – Цвітіння води не небезпечно, але може бути проблемою в тому випадку, якщо у водоймищі є збудники інфекцій. За цим слідкує санітарно-епідеміологічна служба міста та попереджає городян про те, де купатися можна, А де не можна.
Купання у квітучому морі небезпечно для дітей, алергіків і навіть може призвести до смерті. Через нервово-паралітичну дію може статися зупинка дихання. Небезпеку для людини становлять навіть морепродукти, виловлені у таких районах.