Неможливість вимкнути МРТ система охолодження повинна функціонувати постійно для підтримки температури надпровідника – кріогенний МРТ не можна відключити від живлення. Тобто, для постійної та стабільної роботи потрібне дуже потужне Джерело Безперебійного Живлення.
У разі виникнення дискомфорту процедуру можна зупинити та завершити. Але через переговорний пристрій слід повідомити лікаря про проблеми, що виникли.
Існують і банальніші причини виникнення страху перед таким дослідженням. У кожного, хто страждає на клаустрофобію (страх замкненого простору), виникає панічний страх і страх мрт, оскільки сам апарат є трубою, в якій повинен частково або повністю перебувати пацієнт.
Апарат МРТ під час роботи робить дуже гучний стукіт, до якого ви повинні бути готові, якщо збираєтеся проходити МРТ обстеження. Стук відбувається з-за вібрації металевих спіралей у машині, що викликається швидкими імпульсами електроенергії.