Наразі приставка ПРЕ вже є частиною кореня. Проте написання залежить від значення колишньої приставки (ПРИ/ПРЕ). В даному випадку «нехтувати» означає бути дуже недбалим. У значенні «дуже» пишеться приставка ПРЕ, відповідно правильно — «нехтувати».