Однією з основних причин зелених навколоплідних вод є гіпоксія плода, що виникає у зв'язку з недостатньою кількістю кисню. При цьому відбувається рефлекторне скорочення заднього отвору і виділяється перший кал малюка – меконію, який і надає воді зеленого забарвлення.
Найчастіше причиною позеленіння вод при пологах буває гіпоксія плода. Через нестачу кисню відбувається рефлекторне скорочення сфінктера заднього проходу і виділяється первородний кал дитини – меконій. Саме він надає амніотичній рідині характерного забарвлення.
У нормі навколоплідні води прозорі, як вода. До кінця вагітності вони іноді трохи каламутніють через те, що в них потрапляють клітини епідермісу зі шкіри малюка, частки первородного мастила — вони й дають невелику завись у водах, яку видно на УЗД. Це також варіант норми.
Меконіально-забарвлені навколоплідні води (МООВ) є результатом виходу матеріалу з товстої кишки плода амніотичну порожнину матері. Його частота збільшується при переношуванні вагітності.