Рівень радіації при дослідженні КТ коливається між 2 і 10 мЗв, що практично дорівнює кількості радіації, яку людина отримує з довкілля за 3-5 років. Зазвичай КТ не рекомендується вагітним жінкам та дітям, лише якщо це життєво необхідно. При МРТ дії радіації немає.
на МРТ краще видно м'які тканини, тому метод використовується виявлення пухлин, дослідження мозку, хребта, суглобів, малого таза. КТ добре показує травми, переломи, свіжі крововиливи, патології черевної порожнини та грудної клітки.
Тому на запитання, що шкідливіше, однозначною відповіддю буде рентгенографічний метод. Основним недоліком МРТ перед рентгеном є неможливість зробити МРТ пацієнта, який страждає на клаустрофобію, що використовує кардіостимулятор або має інші металеві об'єкти в тілі.
Відмінність МРТ від КТ Комп'ютерна томографія (КТ) найкраще сприймає кісткові структури. Тому КТ добре використовуватиме визначення кісткових травм і різних ушкоджень. на МРТ добре видно м'які тканини: м'язи, судини, хрящі, спинний та головний мозок.