У цілому нині цей процес називається окислювальним фосфорилированием. Він протікає і в мітохондріях еукаріотів, на внутрішній мембрані яких розташовані молекули АТФ-синтази, причому компонент F1 знаходиться в матриксіде і протікає процес синтезу АТФ з АДФ і фосфату
Якщо цикл Кребса відбувався у матриксі мітохондрій, то окисне фосфорилювання буде відбувається у внутрішній мембрані мітохондрій, за рахунок білків які в неї вбудовані.
Огляд окисного фосфорилювання. В результаті роботи ланцюга перенесення електронів на внутрішній мембрані мітохондрії утворюється протонний градієнт, який сприяє синтезу АТФ в процесі хеміосмосу.
АТФ-синтаза АТФ-синтаза, також відома як комплекс V, є кінцевим ферментом окисного фосфорилювання. Цей фермент є у всіх форм життя і функціонує однаково і у прокаріотів, і у еукаріотів.