Глікоген запасається в м'язах та печінці. Коли глюкоза не надходить у кровотік із їжі, запускається процес розпаду глікогену до глюкози – глікогеноліз. М'язи, що працюють, беруть глюкозу безпосередньо з глікогену, що міститься в них же самих.
Глікоген є основною формою зберігання енергії глюкози у тварин клітинах (у рослинах глікогену ні). У тілі дорослої людини накопичується приблизно 200-300 г глікогену, що запасається переважно в печінці та в м'язах.
Глікоген міститься у печінці, м'язах та інших тканинах. Якщо людина має масу 70 кг, то в її печінці (1,8 кг) може бути 70-135 г, а в м'язах (32 кг) 300-900 г глікогену. Глікоген печінки необхідний освіти глюкози як джерела енергії для ЦНС (мозку), клітин крові, нирок.
Глікогеногенез відбувається у всіх тканинах тварин, проте в основному він має місце в печінці та м'язах.