Микола Гоголь ніколи не був одружений і вважав за краще вести замкнутий спосіб життя. Про його особисте життя збереглося мало даних, що спричинило виникнення низки гіпотез про його гомосексуальність. Відомо, що у 1829 році Гоголь раптово виїхав з Петербурга до Любеку.
Існує думка, що письменник помер від виснаження через надмірного аскетизму, викликаного психічною хворобою. Професор психіатрії Д. Є. Мелехов вважає, що письменник був схильний до маніакально-депресивного психозу або нападоподібної шизофренії, яка виявилася в нездоровій формі релігійності.
Гоголь дуже сильно був прив'язаний до свого песика Джозі породи мопс, подарованої йому Пушкіним Коли ж собачка здохла (Гоголь тижнями не годувала тварина), на Миколи Васильовича напала смертельна туга та зневіра.
— Він сам зізнавався у листі до свого найближчого друга Олександра Данилевського у 1832 році, що його натура така чуттєва, що полум'я кохання в одну мить спопелило б його. А єдиною жінкою, яка зізналася самому Гоголю у коханні була його двоюрідна сестра Марія Синельникова — дочка сестри матері письменника.