Автором ідеї ЄДІ став міністр Володимир Філіппов, а реалізатором Володимир Хлєбніков.
Перші прообрази ЄДІ стали з'являтися у Росії 1997 року. В окремих школах почали проводити експерименти із добровільного тестування випускників. Автором ідеї Єдиного державного іспиту у Росії став Володимир Філіппов, який очолював Міністерство освіти з 1998 по 2004 рік.
На запитання: «Хто придумав ЄДІ в Росії?" – Є однозначна відповідь: Філіппов Володимир Михайлович. Він вважав, що тестова форма іспиту впорається з цими проблемами.
Офіційно ЄДІ у Росії ввели у 2009 року. Він став обов'язковим як випускний і вступний іспит. За цей час і завдання у тестах та кількість предметів неодноразово змінювали. Коли тільки ввели ЄДІ, то здавали російську та математику.