Організацію проведення ЄДІ здійснює Федеральна служба з нагляду у сфері освіти та науки спільно з органами виконавчої влади суб'єктів Російської Федерації, які здійснюють управління у сфері освіти.
ЄДІ організується та проводиться Федеральною службою з нагляду у сфері освіти та науки (далі – Рособрнагляд) на території Російської Федерації спільно з органами виконавчої влади суб'єктів Російської Федерації, за межами території Російської Федерації – спільно з засновниками російських освітніх установ.
Згідно з ним, організатором ЄДІ є Федеральна служба з нагляду у сфері освіти та науки (Рособрнагляд).
Федеральна служба з нагляду у сфері освіти та науки (Родібнагляд) (відеоспостереження за ЄДІ)