Встановлення меж водоохоронних зон та меж прибережних захисних смуг водних об'єктів, у тому числі позначення на місцевості за допомогою спеціальних інформаційних знаків, здійснюється у порядку, встановленому Урядом Російської Федерації.
Дізнатись, знаходиться ділянка в межах водоохоронної зони чи ні, можна з виписки з ЄДРН. Там потрібно дивитися «відомості про те, що земельна ділянка частково чи повністю входить до зону з особливими умовами використання території водоохоронну зону».
Ширина водоохоронної зони залежить від протяжності водного об'єкта і становить для річок (струмів) протяжністю до 10 км – у розмірі 50 м, від 10 до 50 км – 100 м, понад 50 км – 200м, для моря водоохоронна зона складає 500 метрів.
Ширина водоохоронної зони озер та водосховищ з акваторією 0,5 квадратного кілометра та більше встановлюється у розмірі п'ятдесяти метрів. Ширина водоохоронної зони водосховища, розташованого на водотоку, встановлюється рівною ширині водоохоронної зони цього водотоку.