Троцький на чолі Червоної армії був фактично з 14 березня 1918 року як народний комісар спочатку військових справ, а потім і військово-морських справ. Аж до 1925 року більшовицька пропаганда розглядала Льва Троцького як одного з вождів Червоної Армії, а опоненти як військового лідера більшовизму.
Троцький став керівником Петроградської ради робітничих і солдатських депутатів і, за оцінкою Річарда Пайпса, відсутність Леніна фактично очолював діяльність більшовиків у Петрограді аж до його повернення.
У січні 1928 року Троцький, так само, як і ряд прихильників, що його особливо завзяли, був висланий в Алма-Ату (див. Посилання Троцького в Алма-Аті).