Гастроскопію треба робити за наявності скарг: на дискомфорт, почуття тяжкості та біль у шлунку, особливо пов'язані з прийомом їжі, на печію, печіння за грудиною, відрижку, у т.ч.
Гастроскопія призначається, як правило, у таких випадках: при будь-яких захворюваннях стравоходу, шлунка та кишечника (у тому числі при гастритах, виразковій хворобі, поліпах, пухлинах) з метою диференційованої діагностики; при шлунково-кишкових кровотечах (з метою встановлення їх причини та локалізації);
До відносних протипоказань відносяться: Серцева недостатність Аневризма грудної ділянки аорти, стеноз (звуження) аорти Тяжка гіпертонічна хвороба (гіпертонічний криз)
Робити гастроскопію краще планово, щорічно, якщо нічого не турбує, або раз на півроку, якщо раніше були виявлені хвороби ШКТ.