Фолікулометрія проводиться кілька разів (в середньому 2-3 рази) за менструальний цикл, починаючи з 8-10 дня. Якщо цикл нерегулярний, діагностику можуть призначити раніше чи пізніше: за 4-5 днів до передбачуваної овуляції.