Коріння рослин загнивають, вода стає каламутною і непридатною для життя риб, сірководень, що накопичився, може їх просто отруїти. Також необхідно регулярно сифонувати акваріуми без живих рослин та ґрунту, оскільки біологічні відходи в них не переробляються природним шляхом, осідають на дно та забруднюють акваріум.