Програми, завантажені зі сторонніх джерел, не перевіряються в Apple App Store і тому становлять загрозу безпеці. Після джейлбрейку телефон перестане отримувати оновлення iOS, включаючи оновлення безпеки Apple, що робить його більш вразливими для загроз безпеки.