При гострому отруєнні людей вона вражає мозок, слизові оболонки та шкіру, а при хронічному – кровотворні та статеві клітини. Особливо небезпечна борна кислота для ембріонів, що розвиваються. Навіть надходження одноразової нетоксичної дози в організм матері може спричинити патологічні зміни плода.