Марена красильна широко використовується в народній медицині для лікування сечокам'яної та жовчнокам'яної хвороби. Також марену застосовують при лікуванні захворювань шлунково-кишкового тракту, при запорах, жовтяниці, нічному нетриманні сечі, поліартритах, водянці, подагрі.