МРТ шиї показує взаємне розташування, будову та патологію м'яких тканин та органів цієї частини тіла. На зображеннях, зроблених трьох проекціях, можна розглянути структуру щитовидної залози, слинних залоз, м'язів, зв'язок, судин, лімфовузлів.