Звичайний оптичний мікроскоп (аматорський чи лабораторний) атом показати не може. Пов'язано це із фізикою. Розмір атома набагато менший за довжину видимого світла, що не дозволяє спостерігати його за допомогою світлових мікроскопів.
Саме через довжину хвилі ми й не можемо розглянути атоми і молекули в оптику. Справа в тому, що ці частинки та їх структури набагато дрібніші, ніж та довжина хвилі, яку людське око здатне сприйняти. Самі атоми і молекули не можуть відбивати фотони.
У світловій мікроскоп можна, можливо побачити великі структури розміром від 0,5-1 мкм: ядро, ядерце, пластиди, мітохондрії та апарат Гольджі. Однак ультраструктуру цих органоїдів з допомогою світлового мікроскопа не розглянути.
Вовна миші, вовна зайця, вовна вівці, лапка мухи, лапка бджоли, дафнія, пилок сосни, стебло бавовни, стовбур дерева, зріз сосни і це не повний список що можна побачити в мікроскоп за допомогою цих наборів. Всі ці об'єкти можна, можливо дивитися на різному збільшенні 40, 200, 400, 640, 800, 1200, 1600 та 2000 крат.