Рівень радіації при дослідженні на КТ коливається між 2 і 10 мЗв, що дорівнює кількості радіації, яку людина отримує з навколишнього середовища за 3-5 років. Зазвичай КТ не рекомендується вагітним жінкам та дітям, лише якщо це життєво необхідно. При МРТ дії радіації немає.
Можна констатувати, що на сьогодні МРТ більше інформативна при дифузному та осередковому ураженні структур головного мозку, патології спинного мозку та краніоспінального стику (тут КТ зовсім неінформативна), ураження хрящової тканини. КТ переважна при захворюваннях грудної клітки, живота, тазу.
Основні відмінності КТ від МРТ Обидві методики візуалізують патології організму, але якщо МРТ дає інформацію про стан м'яких тканин, то КТ більшою мірою застосовується з метою оцінки здоров'я кісток та інших твердих тканин.
Коли лікар призначає МРТ мозку або КТ, він керується тим, що потрібно дослідити. Так, КТ вважається більш ефективною при обстеженні твердих тканин, кісток черепа та їх порушень, а МРТ – Для аналізу м'яких тканин.