Мікрозелень можна додавати в салати, супи, закуски, використовувати як самостійний гарнір до м'яса і риби.
Найпростіший спосіб вживання – Використовувати мікрозелень для прикраси звичних страв: салатів, бутербродів, омлетів тощо. Можна приготувати соус, змішавши подрібнену мікрозелень зі сметаною або оливковою олією, а можна просто додавати її до салатів як звичайні зелені культури.
Для такого способу не підходять рослини сімейства Пасльонові (картопля, помідори, баклажани та перець), тому що в їх проростках міститься соланін, який є отруйною речовиною і може призвести до проблем із травленням. Також не варто вирощувати гарбузові рослини, оскільки мікрозелень з них виходить гірка.