У природному середовищі джунгарські хом'яки розмножуються з березня по вересень, у неволі вони розмножуються цілий рік. У посліді може бути від 1 до 11 дитинчат.
Вагітність самі хом'ячка триває в середньому 14-19 днів, а у джунгарських хом'ячків Тривалість вагітності може досягати 30 днів.
Вагітність триває від 15 до 22 днів, у посліді від 1 до 18 дитинчат, які досягають статевої зрілості вже на 6-8 тиждень. Тривалість життя у природі 1-2 роки, у неволі – близько 3 років.