З 2005 року шлюзування маломірних суден у Каналі стало платним. З човнів завдовжки до 10 метрів стягується 2500 руб., а понад 10 метрів – 5000 руб..
Шлюзування будь-яких судів безкоштовно, проте судновласники сплачують навігаційний збір за користування інфраструктурою Каналу їм. Москви. Плату не стягують із маломірних суден (довжиною не більше 20 метрів, максимум із дюжиною пасажирів). Величина збору залежить від обсягу корабля та пройденої відстані (руб./1000 куб.
Вартість 1500 руб/чол.
Судна заходить у камеру через відкриту вхідну пропускну браму, яка після цього закривається. Далі відбувається зміна рівня води в камері до того, що знаходиться на виході. Ворота з протилежного боку камери відкриваються, даючи судну можливість вийти.