Для лікування : по 1 супозиторію 2 рази на добу протягом 7-10 днів. За потреби можливе продовження курсу лікування до 20 днів. Для профілактики інфекцій, що передаються статевим шляхом: 1 супозиторій не пізніше 2 годин після статевого акту.
Інтравагінально. Перед застосуванням супозиторій звільняють від контурної упаковки. Для лікування: по 1 супозиторію 2 рази на добу протягом 7-10 днів. Для профілактики інфекцій, що передаються статевим шляхом: 1 супозиторій не пізніше 2 годин після незахищеного статевого акту.
0,05%, 0,2% розчини застосовують місцево та зовнішньо: 5-10 мл розчину наносять на уражену поверхню шкіри або слизових оболонок сечостатевих органів, ротової порожнини на 1-3 хв 2-3 рази на добу (на тампоні або шляхом зрошення ).
Покази препарату Хлоргексидин лікування бактеріального вагінозу, кольпітів (у т. ч. неспецифічних, змішаних, трихомонадних).