Безпосередньо перед дослідженням увечері та/або вранці кишечник очищають за допомогою клізми (до чистих вод) або за допомогою проносного типу Фортранс, який приймають за інструкцією, що додається до препарату.
Увечері кишечник очищають двічі: о 19-00 та 20-00 годині, або трохи пізніше – о 20-00 та 21-00 год. Разовий обсяг клізми має бути не менше півтора літрів, а «мити» кишечник потрібний до чистої води. Вечірню очищувальну клізму можна поєднувати з прийомом проносних засобів.
Основною умовою для якісного проведення ректороманоскопії є очищення товстої кишки від вмісту. Пацієнтам рекомендується за один-два дні до дослідження перейти на їду легкої їжі. Увечері напередодні ректороманоскопії не рекомендується прийом їжі, за винятком рідини та очистити кишечник.