Обрізання мигдалю виконують відразу посадки. Щоб правильно сформувати крону, висота саджанця не повинна перевищувати 100-120 см., при необхідності основний провідник укорочують. Також обрізають бічні гілки, залишаючи відростки довжиною до 20 см. Крону мигдалю, що плодоносить, формують за аналогією з плодовими деревами.