Алфлутоп вводять глибоко в/м. Зазвичай призначають по 1 мл 1 раз на добу, курс терапії – 20 днів. У разі ураження великих суглобів препарат вводять внутрішньосуглобово по 1-2 мл з інтервалом 3 дні між ін'єкціями. Курс терапії – 5 ін'єкцій у кожний суглоб.