Найбільш поширений варіант консервативного лікування – застосування гормональних препаратів. Для лікування найпоширеніших функціональних кіст (фолікулярних та кіст жовтого тіла) використовують гормон прогестерон або його замінники. Він нормалізує роботу яєчників, мінімізуючи кістоутворення.