Процедуру проводять при широко відкритому роті і притиснутою мовою до дна ротової порожнини, при цьому добре повинні бути видно піднебінні мигдалики. Тубус опромінювача зрізом у бік мигдалика вводять у ротову порожнину на відстань 2-3 см від поверхні зубів. Промінь УФ випромінювання суворо спрямовують на міндалину, що опромінюється.