Оновлення WooCommerce та оновлення будь-яких плагінів краще з вкладки Консоль>>>Оновлення. Там є повідомлення про сумісність нової версії плагіна з версією WordPress. На вкладці Плагіни такої інформації немає. Оновлення досить тривіальне, виділяєте чек-бокс плагіна WooCommerce і тиснете кнопку «Оновити».