При прийомі фамотидину двічі на добу одну дозу слід прийняти вранці, другу – увечері перед сном. Таблетку ковтають повністю, не розжовуючи, запиваючи склянкою води. Фамотидин застосовують незалежно від прийому їжі.
Прийом фамотидин вранці натще або після їди практично не впливав на рівень гастрину в сироватці крові. Прийом фамотидин не впливав на спорожнення шлунка та екзокринну функцію підшлункової залози.
Початкова доза зазвичай становить 20 мг кожні 6 годин і може бути збільшена до 160 мг кожні 6 годин. Для профілактики аспірації шлункового соку при загальній анестезії призначають по 40 мг увечері та/або вранці перед операцією. Пігулки Фамотідіна слід ковтати не розжовуючи, запиваючи достатньою кількістю води.
Всередину, проковтуючи повністю (не розжовуючи), запиваючи достатньою кількістю води. При виразковій хворобі шлунка та дванадцятипалої кишки у фазі загострення, симптоматичних виразках, ерозивному гастродуоденіті зазвичай по 20 мг 2 рази на добу або по 40 мг 1 раз на добу на ніч.