У гастроентерології ротокан застосовують внутрішньо та в мікроклізмах. Всередину застосовують по 1/3-1/2 склянки розчину за 30 хвилин до їди або через 40-60 хвилин після їди, 3-4 рази на день.
Полоскання горла має здійснюватися робочим розчином Ротокана (згідно з інструкцією, препарат повинен бути розведений у воді).
Добова доза становить від 10 до 15 мл (2-3 чайні ложки). Максимальна добова доза становить 30 мл (6 чайних ложок). Місцево: при захворюваннях слизової оболонки порожнини рота водний розчин застосовують шляхом аплікацій (15-20 хв) або полоскань порожнини рота протягом 1-2 хв, 2-3 рази на добу. Курс лікування 2-5 днів.
Ротокан – це ефективний препарат, що використовується в терапії дрібних виразок або афтів, для профілактики розвитку запалення після процедури усунення зубного каміння, а також при болі в горлі; у комплексній терапії при гастриті, коліті, виразкових захворюваннях шлунка та дванадцятипалої кишки.