Застосовують внутрішньо, незалежно від їди. Дорослим та дітям старше 7 років – по 200 мг (2 таблетки) кожні 6 годин (4 рази на добу). Дітям віком 3-7 років – по 100 мг 4 рази на добу. Дітям віком до 7 років бажано призначати препарат у формі суспензії.
Але у 2000 році французьке медичне агентство (FMA) переглянуло використання ніфуроксазиду та заборонило його використання у дітей віком до 2 років. У 2019 р. препарат був заборонено для використання у дітей та підлітків. Було виявлено багато побічних ефектів: анемію, тромбоцитопенію, лейкопенію, алергічні реакції.
Ніфуроксазід слід застосовувати внутрішньо, незалежно від прийому їжі, через рівні проміжки часу. Перед застосуванням суспензію необхідно збовтати. Максимальна добова доза – 800 мг (20 мл). Діти віком від 2 роки: по 5 мл суспензії 3 рази на добу.
Можна приймати ніфуроксазид як з їжею, і натщесерце. Лікувальний ефект ніфуроксазиду не залежить від рН кишкового вмісту.