Збирають сою, як правило, прямим комбайнуванням. Терміни мають бути максимально короткими, оскільки від цього залежить кількість та якість урожаю. Так, при тривалих низьких температурах і вологій погоді насіння починає загнивати, а при тривалій спекотній погоді боби розтріскуються.