Здатність знезаражувати будь-які середовища ефективно працює при лікуванні багатьох захворювань. Використання шунгіта показано при різних хворобах верхніх дихальних шляхів, шлунково-кишкового тракту, жіночих гінекологічних проблемах, алергіях різної етіології.
З високою жорсткістю води Шунгіт не бореться, так що його краще заливати гарною водопровідною водою або водою після фільтру. На великих каменях воду можна, можливо пити за годину, а наполягає вона три дні. Якщо шунгіт дрібний, то часу знадобиться теж менше, оскільки вода може переїсти мінералами.
Не всім підійде лікування шунгітом. При хворобах нирок, тромбозах, онкологічних та серйозних запальних захворюваннях його застосовувати не стоїть. Не використовують його вагітні та жінки, що годують.