Бактерії розмножуються шляхом розподілу клітини навпіл, у результаті утворюються дві однакові клітини — такі самі, як материнська. Такий спосіб називають бінарним поділом.
У бактерій розмноження відбувається шляхом прямого бінарного поділу. Вміст клітини поділяється перетяжкою навпіл і утворюються дві дочірні клітини. Вони ростуть і знову діляться. Бактерії розмножуються швидко.
Бактерії розмножуються розподілом материнської клітини на дві дочірні. За сприятливих умов у багатьох видів бактерій поділ може відбуватися через кожні 20-30 хв. За такої швидкості розмноження потомство однієї бактерії за п'ять діб здатне утворити масу, якою можна було б заповнити всі моря та океани.
У бактерій немає сьогодення статевого процесу, як у еукаріотів, тобто регулярного перемішування всіх ділянок геному. Проте вони поширений горизонтальний генетичний обмін (ГГО; див. Horizontal gene transfer), під час якого одні мікроби запозичують фрагменти ДНК в інших.