У перший день менструації відбувається різке зниження рівня прогестерону і відторгнення функціонального шару ендометрію, що проявляється менструальною кровотечею.. У першій фазі менструального циклу (з 1 по 14-16 день циклу) під дією естрадіолу відбувається проліферація (потовщення) ендометрію до 11-13 мм.

Функціональний шар матки відторгається і виходить із порожнини. Зазвичай повторюється кожні 28 днів і триває 3-6 днів.

Ендометрій — це внутрішній, матковий шар, що регулярно оновлюється, необхідний для росту і розвитку заплідненої яйцеклітини. Поза вагітністю слизова відторгається як менструації. На місці, що звільнилося, розростається новий шар. При вагітності менструації припиняються.

під час менструації ендометрій виходить дрібними фрагментами. Буває ситуація, коли його наростає багато, через порушення гормонального фону: функції яєчників або щитовидної залози.