Виводиться нирками та з фекаліями. При виведенні із сечею: у незміненому вигляді – 20–30% (при прийомі таблеток 250 та 500 мг 2 рази на добу) або 40% (при прийомі 250 мг у вигляді суспензії 2 рази на добу); 14-ОН кларитроміцин становить 10 і 15% виведених із сечею доз 250 та 500 мг, що застосовуються 2 рази на добу відповідно.