Кал найпростіше зібрати з підгузника – треба брати вміст із поверхні. Об'єм зібраного матеріалу повинен бути приблизно 5-10 г (1-2 чайні ложки). Якщо випорожнення у малюка рідкі, а аналіз необхідний, доведеться покласти дитину на медичну клейонку і потім акуратно перелити вміст у контейнер.