Симптоми атипової пневмонії у дорослих часто має легкий перебіг або середньої тяжкості. Характерні симптоми – невисока тривала температура, сухий кашель до 2 – 3 тижнів, слабкість, розбитість, біль голови і нездужання. Зазвичай страждають обидві легені, але відсоток ураження невеликий.

Атипові пневмонії зазвичай відрізняються згладженістю «класичних» симптомів (середня кількість мокротиння, що відокремлюється, відсутність легеневої консолідації, невеликий лейкоцитоз і т. д.) з переважанням в клінічній картині другорядних симптомів – головного болю, міалгії, болю і першіння в горлі, слабкості.

Першими проявами прихованого запалення легень є значна стомлюваність при фізичних навантаженнях, блідість шкіри, напади прискореного серцебиття, скрутне дихання.