На думку більшості булгакознавців, основним прототипом Маргарити була Олена Сергіївна Булгакова, третя та остання дружина письменника, яку він називав: «Моя Маргарита».
Маргарита бачить талант свого коханого, підтримує його у всьому, перечитує все написане ним та проживає кожен рядок. Тому така шалена була вона у своїй помсті критику Латунського, який розгромив роман Майстра про Понтія Пілата. Взагалі Маргарита – Жінка рішуча і безстрашна.
Маргарита стає відьмою. Продавши свою душу, вона отримує Майстра. Наприкінці роману вона, як і її коханий, заслуговує на спокій. Багато хто вважає, що прототипом цього образу послужила дружина письменника Олена Сергіївна Булгакова.